تأسس القسم منذ تاسيس كلية الزراعة في السنة الدراسية 2005-2006 واستقبل (30) طالب وطالبة، خرًج القسم في العام 2009 – 2010 اول دفعة من المهندسين الزراعيين القادرين على المساهمة في حل المشكلات الزراعية والبيئية واستمر القسم في استقبال طلابه المتزايدين يوما بعد الاخر.يمنح القسم شهادة البكالوريوس في العلوم الزراعية والماجستير في اختصاصات الوقاية (امراض نبات، علم الحشرات، علم النبات والمبيدات).يساهم منتسبو قسم الوقاية بشكل فاعل في نشاطات المكتب الاستشاري الزراعي بتقديم العديد من الاستشارات في مكافحة الافات الزراعية ولاسيما في مكافحة حشرة الارضة في الابنية، ومكافحة الآفات في الزراعة المحمية والمكشوفة. وقد اثبت خريجو قسم الوقاية كفاءة عالية ونجاحاً متميزاً في الحياة العملية اذ لا يخلو مشروع زراعي سواء كان تابعاً للقطاع العام او الخاص من خريج لقسم الوقاية. وكلنا امل في تطور المسيرة العلمية للقسم بما يحقق تقدم لوطننا العزيز بعون الله تعالى .
رسالة القسم
تتمثل رسالة القسم في تطبيق الانظمة التعليمية العالية والحديثة لتهيئة جيل من المهندسين الزراعين والباحثين قادر على حل جميع المشاكل التي تتعلق بالإنتاج الزراعي ,وكذلك القيام بالدراسات والابحاث العلمية التي من شأنها ان ترفع المستوى العلمي والتطبيقي للكوادر المتخصصة بمجال وقاية النبات .
رؤية القسم
يطمح قسم وقاية النبات ان يكون الافضل في التعلم والبحوث العلمية وتقديم النصائح والاستشارات العلمية القيمة التي تسهم بارتقاء المحاصيل الزراعية الى اعلى المستويات وحماية المزروعات من خطر الافات العديدة التي تهددها من اجل مصلحة المجتمع .
اهداف القسم
نشر المعرفة بين طبقات المجتمع حول اهمية سلامة المنتجات الزراعية مثل خلوها من الامراض وبقايا المبيدات الخ.
القيام بالأبحاث العلمية التي تسهم في ايجاد الحلول البديلة عن استخدام المبيدات .
تنمية الوعي الزراعي والعاملين في مجال الزراعة ونشر المعلومات الحديثة للحصول على افضل المنتجات الزراعية .
التعاون مع جهات حكومية اخرى كالمركز الارشادية والبحثية ومديريات الزراعة في محافظة المثنى من اجل تبادل الخبرات والمعرفة والاطلاع على اخر المستجدات في مجال الزراعة ووقاية النبات.